Cluster Svarog

This page is read only. You can view the source, but not change it. Ask your administrator if you think this is wrong.
====== HPC Cluster Svarog ======

===== Výpočtové zdroje =====

== 70x Compute node ==
  * 2 x 10 jadrovy Intel(R) Xeon(R)
  * 750GB RAM
  * 1 x 500GB HDD
  * OS CentOS 8.3
  * Ethernet, InfiniBand

== Filesystem ==
  * /datafs1/home/$USER - xfs

== Fronty uloh ==

  * qparallel - walltime=240 hod, max nodes=20, max ncpus=400,

===== Prihlásenie =====

<code>
ssh user@login.svarog.hpc.uniza.sk
</code>

Zmena hesla
<code>
smbldap-passwd
</code>

== Enviroment moduly ==

<code>
$module avail
$module load  matlab/2021a
$module unload  matlab/2021a
...
</code>

===== Spustenie a spravovanie výpočtových úloh =====

<code>
$ qsub s1.pbs
</code>

== Skript pre ulohu ==

<code>

#!/bin/bash
#PBS -A PROJEKT1
#PBS -N PROJEKT1_NAZOV
#PBS -q qparallel
#PBS -l nodes=8:ppn=20,mem=300gb,walltime=0:10:00
#PBS -m ae
#PBS -M uzivate@uniza.sk

cd /work/user/hpl

module load openblas/0.3.7
module load openmpi4/4.0.5
module load gnu9/9.3.0

cat $PBS_NODEFILE > nodes.hosts

mpirun --hostfile nodes.hosts xhpl > OUT

</code>

== Kontrola úloh ==

<code>
$ qstat -a
</code>

== Vymazanie úlohy z fronty ==

<code>
$ qdel  jobid
</code>

== Navod  - Spustenie úlohy v interktívnom režime ==

<code>
qsub -I -X -l nodes=1:ppn=20 -q qparallel -A PROJECT1 -N PROJECT1_Interacitve
</code>


Po zaradení úlohy a pridelení zdrojov ste automaticky presmerovaný na pridelený výpočtový nod.

== Spustenie aplikácie na výpočtovom node ==

napr. spustenie matlabu 

<code>
[comp01]# module load matlab/2021a
[comp01]# matlab &
</code>

===== Kontakt - Centrum IKT =====

Centrum Informacnych a komunikacnych technologii \\
Zilinska univerzita\\
tel: +421 41 513 1851\\
email: hpc@uniza.sk\\
Cluster Svarog

User Tools

Site Tools

Page Tools
