HPC Cluster Svarog

Výpočtové zdroje

70x Compute node

2 x 10 jadrovy Intel(R) Xeon(R)
750GB RAM
1 x 500GB HDD
OS CentOS 8.3
Ethernet, InfiniBand

Filesystem

/datafs1/home/$USER - xfs

Fronty uloh

qparallel - walltime=240 hod, max nodes=20, max ncpus=400,

Prihlásenie

ssh user@login.svarog.hpc.uniza.sk

Zmena hesla

smbldap-passwd

Enviroment moduly

$module avail
$module load  matlab/2021a
$module unload  matlab/2021a
...

Spustenie a spravovanie výpočtových úloh

$ qsub s1.pbs

Skript pre ulohu

#!/bin/bash
#PBS -A PROJEKT1
#PBS -N PROJEKT1_NAZOV
#PBS -q qparallel
#PBS -l nodes=8:ppn=20,mem=300gb,walltime=0:10:00
#PBS -m ae
#PBS -M uzivate@uniza.sk

cd /work/user/hpl

module load openblas/0.3.7
module load openmpi4/4.0.5
module load gnu9/9.3.0

cat $PBS_NODEFILE > nodes.hosts

mpirun --hostfile nodes.hosts xhpl > OUT

Kontrola úloh

$ qstat -a

Vymazanie úlohy z fronty

$ qdel  jobid

Navod - Spustenie úlohy v interktívnom režime

qsub -I -X -l nodes=1:ppn=20 -q qparallel -A PROJECT1 -N PROJECT1_Interacitve

Po zaradení úlohy a pridelení zdrojov ste automaticky presmerovaný na pridelený výpočtový nod.

Spustenie aplikácie na výpočtovom node

napr. spustenie matlabu

[comp01]# module load matlab/2021a
[comp01]# matlab &

Kontakt - Centrum IKT

Centrum Informacnych a komunikacnych technologii
Zilinska univerzita
tel: +421 41 513 1851
email: hpc@uniza.sk

Cluster Svarog

User Tools

Site Tools

Table of Contents